凍干機(jī)控制系統(tǒng)應(yīng)具有凍干曲線設(shè)定、除菌滅菌、在線清洗、真空控制，干燥狀態(tài)檢測，故障報(bào)警器維修檢查等功能。一個研發(fā)凍干機(jī)或者生產(chǎn)型凍干機(jī)或者中試型凍干機(jī)的控制系統(tǒng)要能進(jìn)行全自動的凍干控制，包括預(yù)凍、加熱、抽真空、壓塞、放氣、除菌滅菌等。在觸摸屏上可以顯示溫度，壓力，時間，周期狀態(tài)等，也可以顯示報(bào)警信息。控制系統(tǒng)應(yīng)可預(yù)先設(shè)置凍干曲線，當(dāng)進(jìn)行全自動操作時，控制著系統(tǒng)需要將預(yù)先設(shè)置好的凍干曲線送入可編程控制器plc，只需要按下執(zhí)行即可自動執(zhí)行.凍干機(jī)軟件可記錄各種運(yùn)行設(shè)備的累計(jì)運(yùn)行時間、歷史記錄、隨機(jī)和定時數(shù)據(jù)報(bào)表曲線等.同時自動記錄多項(xiàng)故障和事件發(fā)生，多點(diǎn)記錄儀可顯示制品溫度，干燥箱體真空泵的真空度等，同時對冷阱的溫度進(jìn)行報(bào)警監(jiān)視，對于中間任何階段可以隨時進(jìn)行人工干預(yù)（有權(quán)限的）.

凍干過程中各階段要求對影響凍干質(zhì)量的各種物理參數(shù)，如干燥箱內(nèi)部的真空度、制品溫度、板層溫度、清洗、滅菌、壓力、設(shè)備運(yùn)行時間等進(jìn)行完整的記錄.。凍干機(jī)控制系統(tǒng)著重強(qiáng)調(diào)凍干工藝的準(zhǔn)確完成和電子記錄的完整性即可追溯性.主要包含1、密碼保護(hù).2、電子記錄可追溯性3、電子記錄完整性。4電子記錄文件格式應(yīng)是不可更改.

凍干控制系統(tǒng)顯示界面主要包含1.系統(tǒng)內(nèi)所有部件的運(yùn)行狀況；2.執(zhí)行操作信息及報(bào)警；3.記錄凍干周期的參數(shù)；4.處理和存儲操作數(shù)據(jù)；5.提供凍干過程報(bào)告；。6排除可能發(fā)生的誤操作；7防止未被授權(quán)的人員進(jìn)入操作系統(tǒng)。

凍干機(jī)的操作系統(tǒng)的功能應(yīng)得到zui大程度的利用，可以自動化的減少人為操作，為批量生產(chǎn)和放大生產(chǎn)打下基礎(chǔ)。但是凍干機(jī)應(yīng)帶半自動操作，也就是前期工藝摸索的過程是采用半自動操作的，等工藝摸索出來可以采用全自動模式運(yùn)行。